Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P20040 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P20040 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P20040 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P20040 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P20040 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P20040 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
P20040 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P20040 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P20040 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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