Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms