Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms