Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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