Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rag1P15919 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms