Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms