Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt1P13864 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms