Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rb1P13405 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rb1P13405 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rb1P13405 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rb1P13405 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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