Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scg5P12961 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg5P12961 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms