Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Calb1P12658 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms