Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt8P11679 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt8P11679 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms