Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa1P11477 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms