Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms