Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

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Length 1,245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nid1P10493 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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