Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem254bP0DN90 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem254bP0DN90 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms