Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms