Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtrP07309 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtrP07309 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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