Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TnfP06804 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TnfP06804 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TnfP06804 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TnfP06804 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms