Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa4P06798 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms