Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-T23P06339 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-T23P06339 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms