Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd4P06332 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd4P06332 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms