Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06324 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06324 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06324 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06324 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06324 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06324 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06324 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06324 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P06324 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06324 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06324 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P06324 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P06324 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms