Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P04213 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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P04213 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04213 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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P04213 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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P04213 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P04213 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P04213 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P04213 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04213 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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