Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
HbaP01942 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HbaP01942 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HbaP01942 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HbaP01942 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HbaP01942 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HbaP01942 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HbaP01942 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms