Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01810 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01810 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01810 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01810 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01810 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01810 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01810 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01810 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01810 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01810 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01810 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01810 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01810 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01810 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01810 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01810 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01810 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01810 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01810 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01810 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01810 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01810 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01810 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms