Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01649 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01649 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01649 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01649 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01649 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01649 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01649 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms