Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01645 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01645 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01645 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01645 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01645 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01645 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01645 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01645 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01645 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01645 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01645 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01645 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01645 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01645 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01645 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01645 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01645 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01645 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01645 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01645 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01645 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01645 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01645 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01645 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01645 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01645 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01645 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms