Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp8O89110 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp8O89110 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms