Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnpda1O88958 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms