Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hcn3O88705 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms