Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dll3O88516 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dll3O88516 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dll3O88516 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms