Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms