Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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