Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AvilO88398 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AvilO88398 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AvilO88398 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AvilO88398 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AvilO88398 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AvilO88398 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AvilO88398 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AvilO88398 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AvilO88398 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AvilO88398 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AvilO88398 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AvilO88398 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AvilO88398 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AvilO88398 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AvilO88398 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms