Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Tnnt1O88346 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Tnnt1O88346 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Tnnt1O88346 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Tnnt1O88346 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Tnnt1O88346 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Tnnt1O88346 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Tnnt1O88346 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Tnnt1O88346 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Tnnt1O88346 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnt1O88346 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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