Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1O70583 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid1O70583 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms