Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SfnO70456 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SfnO70456 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SfnO70456 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SfnO70456 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SfnO70456 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SfnO70456 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SfnO70456 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SfnO70456 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SfnO70456 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SfnO70456 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SfnO70456 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SfnO70456 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SfnO70456 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SfnO70456 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SfnO70456 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SfnO70456 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SfnO70456 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SfnO70456 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SfnO70456 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SfnO70456 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SfnO70456 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SfnO70456 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SfnO70456 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SfnO70456 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SfnO70456 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms