Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfi1bO70237 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfi1bO70237 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfi1bO70237 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfi1bO70237 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfi1bO70237 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1bO70237 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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