Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rpl35aO55142 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rpl35aO55142 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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