Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms