Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms