Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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