Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1bO55017 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1bO55017 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1bO55017 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms