Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms