Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc4O35988 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sdc4O35988 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sdc4O35988 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sdc4O35988 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sdc4O35988 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sdc4O35988 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sdc4O35988 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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