Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab33bO35963 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab33bO35963 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab33bO35963 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab33bO35963 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms