Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FxnO35943 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FxnO35943 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FxnO35943 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FxnO35943 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FxnO35943 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FxnO35943 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FxnO35943 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FxnO35943 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FxnO35943 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FxnO35943 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FxnO35943 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FxnO35943 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FxnO35943 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FxnO35943 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FxnO35943 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FxnO35943 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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