Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms