Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Clk2O35491 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Clk2O35491 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Clk2O35491 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk2O35491 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk2O35491 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Clk2O35491 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Clk2O35491 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Clk2O35491 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Clk2O35491 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk2O35491 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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