Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms